שאלה- רופא תעסוקתי

שלום,
לצורך הורדת אחוזי משרה בעבודה עקב בעיה רפואית, דורש המעסיק אישור מרופא תעסוקתי. שאלתי היא מה קורה במקרה שלמרות האישורים הרפואיים רופא תעסוקתי של הקופה נותן חוו"ד שאינה לטובת החולה או קובעת שכושרו לעבוד אינו נפגע(אני סובלת מבעיה לא מוכרת ורופאים שאינם מהתחום אינם מבינים בד"כ את הקשיים איתם מתמודדים החולים במחלה זו) האם זה עשוי לפגוע בי אח"כ במסגרת הליך תביעה לנכות כללית לביטוח לאומי? האם עדיף לפנות מראש לרופא תעסוקתי פרטי והאם חוות דעתו תתקבל באותה מידת אמינות כמו כזו של רופא מהקופה?
תודה