הבלנת 20% מהשכר- משרד החינוך

שלום, אשתי עובדת במשרד החינוך כמורה ממלאת מקום בשלושה גנים. המפקחת לא דיווחה על גן אחד ובמשך 3 חודשים למרות בקשות חוזרות ונשנות העניין לא מתוקן. כך ש-20% מהשכר שלה לא משולם. חשבת השכר בעבודה שלי אמרה לי שבמשרד החינוך יש הסכמים קיבוציים רבים ויכול להיות שזה אפילו חוקי. האם העניין חוקי או שאפשר לאיים בתביעה של הלנת שכר?