ביטול פטור מס שבח

שלום רב, מבקש להבין את משמעות ביטול הפטור שכן קראתי שהפטור הוא רק על שבח שנוצר מ 1/1/2014. רכשנו דירה בשנת 1999 שעדיין ברשותינו ואנו שוקלים להעמידה למכירה. לפני שנתיים רכשנו דירה בה אנו מתגוררים. מעולם לא מכרנו דירה עד כה. אני מבין שעבור מכירה עד 31/12/2013, יש לנו פטור מלא ממס שבח (עקב העובדה שלא מכרנו דירה ב4 שנים אחרונות). בחישוב גס שעשיתי במחשבון רשות המיסים, המס ללא הפטור עומד על כ- 55,000 ש"ח. כיצד בעצם יחושב המס לפי ההוראות שיחולו על מכירה לאחר 1/1/1014? האם המשמעות היא לקחת בחשבון כ 50,000 ש"ח מס רכישה ?