תשלום מס רכישה בשל הרחבת דירה

כיום הדירה רשומה על שמי במנהל. הדירה נרשמה גם בטאבו, ולשם הגשת מס שבח ורכישה, יש לתקן גוש וחלקה. כשפניתי למיסוי מקרקעין לשם תיקון אישורי המיסים, נמסר לי כי עליי לשלם מס רכישה היות ואני "רכשתי זכות במקרקעין". שכן, שילמתי למנהל דמי היתר בגין הרחבת הדירה. האם מיסוי מקרקעין צודקים? והרי, מקובל כי נכס שנרשם כבר בטאבו ולאחר מכן בוצעה הרחבה, לא משלמים מס רכישה, האם מנהג זה מנוגד לחוק? תודה רבה.