הארכת דרכון לא ביומטרי - אין אפשרות?

דרכון של אשתי פג תוקף שבוע ימים אחרי שהיא חוזרת מחו"ל - אנחנו טסים יום חמישי זה 22.6.2017.
שלמנו אונליין כבר לדרכון חדש ביומטרי, 290 ש"ח, אבל השומר מחוץ למשרד הפנים לא נתן לה להכנס, אמר שהיא לא תקבל הארכה לדרכון שלה, ורק נשאר לה להנפיק דרכון חדש בנתב"ג בעלות 1,120 ש"ח!
הם יכזזו את מה ששלמנו כבר?